Το 401 Γενικό Στρατιωτικό Νοσοκομείο Αθηνών έχει αποστολή την Εκπαίδευση και την Έρευνα.

Α. Νοσηλεία. Το 401 ΓΣΝΑ περιθάλπει και νοσηλεύει:

• Εν ενεργεία Στρατιωτικό Προσωπικό και Μέλη οικογενειών τους.
• Απόστρατους Αξιωματικούς και Υπαξιωματικούς και Μέλη των
  οικογενειών τους
• Προσωπικό Σωμάτων Ασφαλείας
• Πολιτικό Προσωπικό του Υ.ΕΘ.Α.
• Κάθε Έλληνα πολίτη μετά από έγκριση της Διεύθυνσης του
  Νοσοκομείου και των Προϊστάμενων Κλιμακίων

Β. Εκπαίδευση. O Εκπαιδευτικός ρόλος του 401 ΓΣΝΑ περιλαμβάνει:

• Εκπαίδευση Στρατιωτικών Ιατρών και Νοσηλευτών
• Εκπαίδευση Οπλιτών του Υγειονομικού Σώματος Στρατού Ξηράς
• Εκπαίδευση Πολιτικών Ιατρών μετά από έγκριση του Υπουργείου Υγείας

Γ. Έρευνα. Η Ερευνητική αποστολή του 401 ΓΣΝΑ περιλαμβάνει την
διεξαγωγή κλινικών και εργαστηριακών μελετών μέσω της Ερευνητικής
Μονάδας.